25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0180 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  360  5.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  51.13 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  46.72 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  44.92 
 
 
150 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  43.48 
 
 
152 aa  101  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  36.52 
 
 
153 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  37.17 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  39.13 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  30.58 
 
 
151 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  31.5 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  30.95 
 
 
150 aa  61.2  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  30.33 
 
 
150 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  33.04 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  28.93 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  34.43 
 
 
153 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  32.77 
 
 
144 aa  57.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  28.93 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  35.34 
 
 
111 aa  56.6  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  30.47 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  33.62 
 
 
111 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  29.63 
 
 
144 aa  48.9  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  28.35 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  28.1 
 
 
147 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  27.07 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>