283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0014 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_R0058  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  242  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0038  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  242  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0014  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 122 bp  242  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0013  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 121 bp  238  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_R0057  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 121 bp  238  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0039  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 121 bp  238  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0035  5S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 118 bp  117  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0060  5S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 118 bp  117  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0018  5S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 118 bp  117  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0053  5S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 121 bp  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  86.44 
 
 		 122 bp  107  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  86.32 
 
 		 118 bp  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_R0061  5S ribosomal RNA  84.62 
 
 		 118 bp  89.7  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0004  5S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 118 bp  81.8  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.357792  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0028  5S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 118 bp  81.8  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.678943  hitchhiker  0.00874775 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0023  5S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 118 bp  79.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_R0057  5S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 118 bp  79.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_R0055  5S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 118 bp  79.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0004  5S ribosomal RNA  83.62 
 
 		 118 bp  79.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0022  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0790394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0039  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0019  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  0.482048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0036  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0862366  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0025  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0040  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0277328  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0019  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329841  normal  0.0964141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0036  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481647  hitchhiker  0.00452682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  91.84 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  91.84 
 
 		 116 bp  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 117 bp  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0043  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.304759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14048  5S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 124 bp  63.9  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000166402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0003  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0189262  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0034  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0068  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.106732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0022  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0034  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0055  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.579519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0058  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0779086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0053  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0007  5S ribosomal RNA  92.86 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0021  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0021  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 131 bp  60  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0044  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 131 bp  60  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0069  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 131 bp  60  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0076  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0067  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0054  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0077  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0035  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0032  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.113834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0051  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0015  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0017  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.711795  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0047  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0798933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0011  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0029  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.759375  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0055  5S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  88.68 
 
 		 117 bp  58  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  86.89 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0025  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 112 bp  58  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.109821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0038  5S ribosomal RNA  87.72 
 
 		 112 bp  58  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0069  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0037  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.047404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0059  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0070  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0054  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0022  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 115 bp  56  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0032  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0022  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0048  5S ribosomal RNA  85.94 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.424673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0019  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 132 bp  56  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0044  5S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 132 bp  56  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0065  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 116 bp  54  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0066  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.225371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>