27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3240 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3240  integrase family protein  100 
 
 		 380 aa  783    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4009  integrase family protein  54.86 
 
 		 373 aa  401  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4353  hypothetical protein  39.43 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947426  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5046  integrase family protein  33.96 
 
 		 369 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3395  hypothetical protein  32.39 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2941  site-specific recombinase  34.48 
 
 		 407 aa  196  6e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4632  integrase family protein  33.6 
 
 		 380 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4861  integrase family protein  32.45 
 
 		 380 aa  195  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5150  Site-specific recombinase XerD-like protein  37.79 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238574  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3317  hypothetical protein  34.03 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.802831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3444  Site-specific recombinase XerD-like protein  32.46 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.862055  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3406  site-specific recombinase  34.23 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4505  hypothetical protein  41.86 
 
 		 206 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  19.68 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4792  phage integrase family protein  22.92 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2265  phage integrase family protein  22.92 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2972  phage integrase family protein  22.92 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.32 
 
 		 369 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  23.9 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0465  integrase family protein  41.07 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  28.92 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  26.42 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  20.77 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.91 
 
 		 322 aa  43.9  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  25.16 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 297 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.43 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>