24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3120 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  100 
 
 		 310 aa  635    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  72.55 
 
 		 309 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  72.88 
 
 		 309 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  70.03 
 
 		 310 aa  455  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  68.3 
 
 		 309 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  57.19 
 
 		 313 aa  331  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  35.09 
 
 		 271 aa  134  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  35.4 
 
 		 514 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  32.57 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  33.33 
 
 		 502 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  31.44 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  32.88 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  31.45 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  37.32 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  28.35 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0560  hypothetical protein  26.87 
 
 		 471 aa  75.9  0.0000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  26.61 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0077  hypothetical protein  25.34 
 
 		 591 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00310  protein of unknown function (DUF955)  31.31 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  26.74 
 
 		 755 aa  66.6  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0111  hypothetical protein  24.15 
 
 		 589 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06570  protein of unknown function (DUF955)  27.37 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.96837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2265  hypothetical protein  36.19 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1009  hypothetical protein  34.72 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000000366199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>