17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2965 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2965  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  879    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1690  hypothetical protein  53.75 
 
 
370 aa  347  4e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3173  hypothetical protein  58.58 
 
 
417 aa  342  5.999999999999999e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4210  hypothetical protein  46.05 
 
 
353 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1647  hypothetical protein  38.05 
 
 
851 aa  233  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  36.1 
 
 
770 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  36.63 
 
 
647 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  35.29 
 
 
774 aa  155  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  39.51 
 
 
759 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1589  hypothetical protein  34.39 
 
 
187 aa  93.6  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.159507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  34.9 
 
 
848 aa  93.2  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  33.64 
 
 
728 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  30.86 
 
 
751 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0426  phage DNA-polymerase or DNA-primase  24.68 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2163  hypothetical protein  34.71 
 
 
189 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  28.14 
 
 
857 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1658  hypothetical protein  25.43 
 
 
1172 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.815472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>