18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2709 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2709  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0118  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.16 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1227  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.4 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.718162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.97 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.86 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.21 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0993082  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1941  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.98 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3399  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3525  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.7 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  33.87 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0652  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 112 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3060  cupin 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0553  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.08 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 136 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>