25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2555 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2555  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  224  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.981859  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  63.06 
 
 
111 aa  140  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  61.47 
 
 
111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  49.51 
 
 
118 aa  102  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  49.49 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  34.44 
 
 
112 aa  57  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  32.63 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  36.04 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  37.76 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0441  hypothetical protein  34.62 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  33.9 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  30.19 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  29.63 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  35.53 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.19 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  33.73 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  32.53 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  29.25 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0146  hypothetical protein  35.19 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
305 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  31.25 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>