16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1982 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1982  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  444  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.14566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2926  hypothetical protein  41.91 
 
 
232 aa  151  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1034  hypothetical protein  40.51 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0363723 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1376  hypothetical protein  35.43 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1026  hypothetical protein  27.6 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0973529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1651  hypothetical protein  27.19 
 
 
210 aa  62  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.406085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0106  hypothetical protein  29.46 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39004  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1068  hypothetical protein  31.71 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.470708  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2353  hypothetical protein  28.31 
 
 
223 aa  52.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0920  hypothetical protein  30.97 
 
 
212 aa  52  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.143671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0345  hypothetical protein  26.32 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1825  hypothetical protein  29.1 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1427  hypothetical protein  27.57 
 
 
245 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1250  hypothetical protein  28.32 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.093421  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2354  hypothetical protein  30.43 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1065  hypothetical protein  27.4 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.465005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>