53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1007 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  100 
 
 
250 aa  486  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  70.24 
 
 
251 aa  334  7e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  67.06 
 
 
250 aa  315  4e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  74.13 
 
 
258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  69.92 
 
 
255 aa  290  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  48.97 
 
 
256 aa  238  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  45.56 
 
 
261 aa  231  9e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  53.69 
 
 
255 aa  221  7e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  44.77 
 
 
250 aa  202  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  44.35 
 
 
250 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  43.93 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  42.5 
 
 
251 aa  198  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  43.22 
 
 
251 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  47.64 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  45.49 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  43.48 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  44.21 
 
 
256 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  41.11 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  40.17 
 
 
252 aa  156  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  28.63 
 
 
248 aa  101  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  27.24 
 
 
302 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  30.28 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  27.46 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  25.62 
 
 
302 aa  85.5  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  27.43 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0465  hypothetical protein  32.18 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  27.64 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  26.58 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  30.13 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  25.9 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  31.6 
 
 
255 aa  72  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  25.74 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3816  protein of unknown function DUF75  31.8 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  25.82 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  25.21 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0342  protein of unknown function DUF75  30.54 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  27.03 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  26.42 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  26.03 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  26.92 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  28.14 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  23.94 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  24.05 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  23.94 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  20.54 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  24.07 
 
 
253 aa  55.5  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  27.69 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  24.11 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1486  protein of unknown function DUF75  28.45 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.243377  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  24.55 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0765  hypothetical protein  24.6 
 
 
276 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.174527  normal  0.0509855 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0906  hypothetical protein  25.81 
 
 
274 aa  42  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.992976  normal  0.453754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>