31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0319 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  100 
 
 		 129 aa  249  6e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  49.4 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  46.99 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  42.39 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  47.76 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  42.05 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  37.61 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  41.98 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  33.64 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.95 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  35 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  27.78 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  34.44 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  35.9 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  36.05 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  37.66 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  35 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  30.53 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  30.11 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  34.85 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0556  hypothetical protein  37.18 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  24.74 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  35.53 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  25.23 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  25.23 
 
 		 116 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>