More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_R0055 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  95.65 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  95.65 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  95.65 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  95.65 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  92.75 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3259  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0824  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0044  tRNA-Lys  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000117241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0042  tRNA-Lys  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000110387  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0060  tRNA-Lys  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00703391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0061  tRNA-Lys  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0043  tRNA-Lys  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0031  tRNA-Lys  95.65 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00676578  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 79 bp  75.8  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 79 bp  75.8  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 79 bp  75.8  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0029  tRNA-Lys  95.65 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0006  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.711036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0036  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0043  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0023  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0320395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0010  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna118  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000544354  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02962  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0051  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.022056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0071  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0421157  hitchhiker  0.003467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0020  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0076  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41661  normal  0.163514 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2342  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04002  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000208325  normal  0.100759 
 
 
-
 
NC_003295  RS04831  tRNA-Lys  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0006  tRNA-Lys  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0012  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0061328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0013  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0641793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0338  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0083  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456541  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0120  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0015  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0021  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0017  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143613  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0017  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0018  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000139962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0045  tRNA-Lys  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000363633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0050  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00633493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0002  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0076  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000822229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0076  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  normal  0.566101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0002  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.099087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0073  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576385  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0010  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00296143  hitchhiker  0.00854354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0013  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00193967  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0036  tRNA-Lys  97.37 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.415695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2817  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510108  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0042  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118118  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2266  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0140  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0148  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4251  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000189937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4250  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0087  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000568391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4252  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000173353  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0084  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0052  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683016  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0053  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000900565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4657  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.396889999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>