42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1609 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  69.45 
 
 		 528 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  74.25 
 
 		 509 aa  634    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  69.67 
 
 		 533 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  70.97 
 
 		 521 aa  641    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  68.57 
 
 		 535 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  69.89 
 
 		 540 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1609  chlorophyllide reductase subunit Y  100 
 
 		 455 aa  909    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  73.78 
 
 		 508 aa  634  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  73.38 
 
 		 508 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  72.98 
 
 		 508 aa  630  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  73.56 
 
 		 512 aa  628  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  71.08 
 
 		 513 aa  625  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  71.66 
 
 		 502 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  70.37 
 
 		 534 aa  624  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  71.2 
 
 		 500 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  71.43 
 
 		 502 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2979  chlorophyllide reductase subunit Y  73.11 
 
 		 468 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.927182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  71.3 
 
 		 516 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  38.98 
 
 		 422 aa  272  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  34.6 
 
 		 412 aa  261  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  38.8 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  34.2 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  38.01 
 
 		 422 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  35.24 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  32.94 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  33.49 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  32.46 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  32.86 
 
 		 418 aa  242  9e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.05 
 
 		 531 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.53 
 
 		 530 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.58 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.87 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.61 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.49 
 
 		 465 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.05 
 
 		 531 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3481  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.63 
 
 		 425 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.66 
 
 		 532 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  19.91 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  19.91 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2081  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  26.04 
 
 		 376 aa  44.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.18 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.16 
 
 		 466 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>