29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0368 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0368  transport-associated  100 
 
 		 107 aa  217  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  36.78 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  33.67 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  35.9 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  35.9 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  35.9 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  37.68 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  34.33 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  34.33 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  32.47 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2052  transport-associated protein  32 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  31.82 
 
 		 192 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  30.26 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  34.92 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  32.81 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  27.27 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  36.23 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  31.17 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  29.07 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  32.94 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  32.94 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  32.94 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  33 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  39.68 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2798  transport-associated  40.58 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549341  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  32.31 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  26.89 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0194  transport-associated protein  31.43 
 
 		 173 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  28.95 
 
 		 103 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>