138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0300 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 
605 aa  1253    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  29.98 
 
 
574 aa  213  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  24.36 
 
 
507 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0607  hypothetical protein  22.96 
 
 
531 aa  89.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0906909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.59 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.29 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.85 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.48 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5983  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.04 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.538368  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.72 
 
 
374 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  21.57 
 
 
498 aa  68.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.67 
 
 
481 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1448  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 
406 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1466  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
406 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333999  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  20.48 
 
 
492 aa  64.7  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5854  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.88 
 
 
407 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3641  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.41 
 
 
406 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0709667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.41 
 
 
406 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758316  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3646  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.41 
 
 
406 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.759222 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0846  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.63 
 
 
559 aa  64.7  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.203875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4556  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.24 
 
 
407 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.745209  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.43 
 
 
407 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5721  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.58 
 
 
407 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.517786  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0904  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.76 
 
 
407 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5287  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.58 
 
 
407 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.070896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.24 
 
 
256 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.35 
 
 
411 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.25 
 
 
328 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0160  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
328 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0141  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
328 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.38 
 
 
370 aa  60.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.86 
 
 
294 aa  60.5  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.52 
 
 
155 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2542  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.21 
 
 
406 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.26 
 
 
470 aa  60.1  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1014  hypothetical protein  30.6 
 
 
190 aa  59.7  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00318676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.15 
 
 
376 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.29 
 
 
170 aa  57.4  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4532  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 
406 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.57 
 
 
206 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1698  hypothetical protein  30 
 
 
417 aa  55.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.41368e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4102  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.37 
 
 
406 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00342341  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0040  hypothetical protein  31.36 
 
 
464 aa  55.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0855  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.47 
 
 
541 aa  55.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.914763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.33 
 
 
171 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2863  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.27 
 
 
339 aa  55.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.772314  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1021  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.62 
 
 
417 aa  54.7  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  normal  0.540486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  28.03 
 
 
253 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2030  hypothetical protein  28.44 
 
 
481 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.533222  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1018  hypothetical protein  34.35 
 
 
450 aa  53.9  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.09 
 
 
272 aa  53.9  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.55 
 
 
219 aa  53.9  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3256  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.66 
 
 
406 aa  53.9  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2927  hypothetical protein  27.52 
 
 
482 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.75 
 
 
289 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12539  lipoprotein lppS  28.28 
 
 
408 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.43439e-50  hitchhiker  0.00210001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2244  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.53 
 
 
476 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111887  decreased coverage  0.00847254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2947  hypothetical protein  27.52 
 
 
481 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0687281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3259  hypothetical protein  27.52 
 
 
481 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3256  hypothetical protein  27.52 
 
 
481 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.218487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3002  hypothetical protein  27.52 
 
 
482 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0878761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2989  hypothetical protein  27.52 
 
 
482 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 
253 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3232  hypothetical protein  27.52 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  21.44 
 
 
521 aa  52.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4535  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.53 
 
 
345 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3989  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.58 
 
 
186 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1160  hypothetical protein  26.81 
 
 
350 aa  52.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.74704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3224  hypothetical protein  27.52 
 
 
498 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3238  hypothetical protein  27.52 
 
 
481 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1911  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.15 
 
 
464 aa  52  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.462593  normal  0.780803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0177  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.43 
 
 
341 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4187  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.71 
 
 
407 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  26.52 
 
 
253 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 
253 aa  51.2  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3147  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 
431 aa  51.2  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4260  hypothetical protein  29.1 
 
 
186 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  26.52 
 
 
253 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0825  hypothetical protein  27.27 
 
 
253 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2602e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4221  hypothetical protein  29.85 
 
 
186 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00480298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.19 
 
 
253 aa  50.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.01 
 
 
217 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25 
 
 
216 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0479  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.81 
 
 
323 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.035674 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4055  hypothetical protein  29.1 
 
 
186 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1458  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.03 
 
 
406 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3894  ErfK/SrfK protein  29.1 
 
 
186 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000648074  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3901  erfK/srfK protein  29.1 
 
 
186 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00361052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4526  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.91 
 
 
434 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442716 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4372  hypothetical protein  29.1 
 
 
186 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3138  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.23 
 
 
402 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.4 
 
 
230 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4170  hypothetical protein  29.1 
 
 
186 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4281  hypothetical protein  29.1 
 
 
186 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0049222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0975  hypothetical protein  28.36 
 
 
186 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0886923  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2614  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.03 
 
 
388 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000221676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 
194 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2208  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  22.2 
 
 
552 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.827056  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0668  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.87 
 
 
253 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4392  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 
194 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>