55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3265 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3265  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 389 aa  789    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2288  class II aldolase/adducin-like  74.55 
 
 		 391 aa  591  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00052721  normal  0.0891696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0906  class II aldolase/adducin family protein  74.41 
 
 		 385 aa  584  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58056e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3340  class II aldolase/adducin family protein  73.44 
 
 		 386 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2190  class II aldolase and adducin N-terminal domain-containing protein  73.83 
 
 		 388 aa  558  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1876  class II aldolase/adducin family protein  42.53 
 
 		 382 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000546395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1249  L-fuculose phosphate aldolase  40.66 
 
 		 189 aa  122  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1355  class II aldolase/adducin family protein  36.41 
 
 		 191 aa  110  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0389357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2210  L-fuculose phosphate aldolase  33.16 
 
 		 183 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000461155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1450  L-fuculose phosphate aldolase  34.07 
 
 		 186 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.571414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1641  L-fuculose phosphate aldolase  32.8 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.515005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1385  L-fuculose phosphate aldolase  32.62 
 
 		 193 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.190215  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1523  aldolase, class II  31.75 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.854462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1027  L-fuculose phosphate aldolase  30.81 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0314  L-fuculose phosphate aldolase  30.99 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  31.61 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3173  L-fuculose phosphate aldolase  30.29 
 
 		 178 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1661  L-fuculose phosphate aldolase  30.51 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1801  L-fuculose phosphate aldolase  30 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30516  normal  0.168684 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1037  class II aldolase/adducin family protein  28.65 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.093036  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0823  class II aldolase/adducin family protein  27.59 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.345059  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  32.58 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  29.25 
 
 		 214 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  27.66 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0426  class II aldolase/adducin family protein  27.72 
 
 		 191 aa  51.2  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000249785  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  28.34 
 
 		 214 aa  50.8  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  29.7 
 
 		 220 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  29.21 
 
 		 207 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  32.99 
 
 		 324 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  28.8 
 
 		 209 aa  46.6  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  34.58 
 
 		 220 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  36.89 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  33.64 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  25.82 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  25.14 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  27.81 
 
 		 216 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1529  class II aldolase/adducin family protein  25.86 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599207  normal  0.531556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  33.33 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  37.5 
 
 		 225 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  27.06 
 
 		 214 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  26.52 
 
 		 216 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  33.09 
 
 		 220 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  31.25 
 
 		 218 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  25.56 
 
 		 230 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  34.95 
 
 		 213 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  24.44 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28 
 
 		 212 aa  43.5  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.67 
 
 		 212 aa  43.5  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  37.04 
 
 		 226 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  27.7 
 
 		 190 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  35.19 
 
 		 222 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  31.45 
 
 		 212 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  24.77 
 
 		 218 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  24.77 
 
 		 218 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  33.09 
 
 		 220 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>