19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1927 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1927  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1861  putative type IV pilus assembly protein PilO  44.89 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.587528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1780  hypothetical protein  38.67 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0245838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2417  putative type IV pilus assembly protein PilO  39.08 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1282  hypothetical protein  39.67 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3001  hypothetical protein  43.24 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000261041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1464  putative type IV pilus assembly protein PilO  30.26 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0134  hypothetical protein  26.45 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1681  hypothetical protein  20.71 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0160  type IV pilus biogenesis protein PilO  27.91 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.546604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02975  hypothetical protein  24.3 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.519706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1338  putative transmembrane protein  21.78 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1298  transmembrane protein  23.42 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0210  pilus assembly protein, PilO  25.49 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216288  hitchhiker  0.0081665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  23.86 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1516  hypothetical protein  24.65 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1005  hypothetical protein  30.34 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0337  pilus assembly protein PilO  24.51 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5579  pilus assembly protein PilO  30.38 
 
 		 225 aa  41.2  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>