21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1747 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1747  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  80.95 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1359  hypothetical protein  65.12 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.477987  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0849  hypothetical protein  69.05 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.103296  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  64.1 
 
 
279 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3302  hypothetical protein  65 
 
 
273 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  69.23 
 
 
274 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1262  hypothetical protein  57.14 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.157552  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0736  hypothetical protein  64.29 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.19722  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1443  hypothetical protein  59.52 
 
 
274 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.450311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0556  hypothetical protein  54.55 
 
 
275 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0652  KilA domain protein  64.1 
 
 
267 aa  58.2  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3883  KilA domain protein  57.5 
 
 
290 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13443 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1392  hypothetical protein  59.52 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0108941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2549  hypothetical protein  60 
 
 
279 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.953779  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  55 
 
 
286 aa  54.3  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0480  hypothetical protein  63.41 
 
 
271 aa  53.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  58.97 
 
 
273 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0917  hypothetical protein  61.11 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119531  hitchhiker  0.000000334371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2517  hypothetical protein  45 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  51.28 
 
 
279 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>