14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1200 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1200  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 111 aa  221  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  77.48 
 
 		 111 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  31.93 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  31.09 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  30.48 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  29.09 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  27.84 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  26.74 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2462  DNA polymerase, beta-like region  37.7 
 
 		 94 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 		 155 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  43.9 
 
 		 732 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>