38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0384 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  43.48 
 
 
188 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  41.76 
 
 
188 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  48.02 
 
 
213 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  39.16 
 
 
183 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  34.95 
 
 
184 aa  101  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  38.59 
 
 
232 aa  94.7  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  36.81 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  35.29 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  35.39 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  38.66 
 
 
173 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  44.19 
 
 
145 aa  84.7  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  33.73 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  39.56 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  30.61 
 
 
177 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  37.62 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  25.82 
 
 
265 aa  78.6  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  31.01 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  38.64 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  38.27 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  32.97 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  31.5 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  27.39 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  34.15 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  32.11 
 
 
135 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  34.15 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  29.73 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  33.94 
 
 
177 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  35.77 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  35.77 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  29.93 
 
 
283 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  32.5 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  26.57 
 
 
329 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  28.95 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  24.85 
 
 
270 aa  45.1  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  35.71 
 
 
321 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  22.92 
 
 
313 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>