49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2921 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  100 
 
 		 546 aa  1006    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  50.29 
 
 		 542 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  50.67 
 
 		 542 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  50.67 
 
 		 542 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  35.2 
 
 		 561 aa  143  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  29.65 
 
 		 566 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  32 
 
 		 548 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  31.14 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  29.61 
 
 		 555 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  33.18 
 
 		 527 aa  113  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  26.76 
 
 		 534 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  29.94 
 
 		 530 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  30.54 
 
 		 550 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  29.92 
 
 		 565 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  30.62 
 
 		 526 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  29.68 
 
 		 551 aa  106  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  32.13 
 
 		 551 aa  102  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  31.39 
 
 		 552 aa  98.2  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  28.67 
 
 		 529 aa  97.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  33.73 
 
 		 529 aa  94.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  29.55 
 
 		 531 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.02 
 
 		 545 aa  91.3  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  32.85 
 
 		 533 aa  88.6  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  30.77 
 
 		 532 aa  87.4  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  32.69 
 
 		 528 aa  87.4  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  30.8 
 
 		 552 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  29.5 
 
 		 652 aa  77  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  29.92 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.18 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  28.79 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  30.99 
 
 		 532 aa  73.6  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  32.14 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5398  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  37.21 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  27.73 
 
 		 548 aa  67  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  28.87 
 
 		 533 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  28.99 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  30.58 
 
 		 539 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  20.65 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  21.07 
 
 		 536 aa  58.5  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  37.4 
 
 		 544 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  31.25 
 
 		 523 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  29.39 
 
 		 532 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  29.39 
 
 		 532 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  29.39 
 
 		 532 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  30.13 
 
 		 541 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1773  hypothetical protein  29.5 
 
 		 546 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  27.63 
 
 		 540 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  26.36 
 
 		 527 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  30.18 
 
 		 266 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>