39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0859 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 117 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  79.45 
 
 		 77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  78.87 
 
 		 77 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  85.19 
 
 		 75 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  75 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  43.84 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  55.77 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  55.77 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0561  DNA binding domain-containing protein  52.83 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  50 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  48.08 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  40.3 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  44.07 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  59.38 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  46.81 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  40.74 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2085  hypothetical protein  43.94 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  45.9 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  38 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  42.59 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3886  hypothetical protein  48.57 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0711  putative transcriptional regulator  47.92 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  43.1 
 
 		 94 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  40.32 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  45.83 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3991  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5292  hypothetical protein  41.67 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  43.1 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3570  excisionase/Xis, DNA-binding  37.5 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  44.44 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3843  hypothetical protein  38.71 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  47.06 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  47.06 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  47.06 
 
 		 91 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  47.06 
 
 		 91 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>