32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0593 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  34.96 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  41.04 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  41.04 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  52.13 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  42.48 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  41.41 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  41 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  49.48 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  40 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  33.5 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  40 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  43.69 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  40.3 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  35.47 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  37.36 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  30.94 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  37.19 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  43.81 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  30.47 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  30.21 
 
 		 660 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  37.17 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4038  hypothetical protein  34.91 
 
 		 331 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3371  hypothetical protein  43.12 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  25.84 
 
 		 322 aa  46.2  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  40 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  27.32 
 
 		 320 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25290  Flp pilus assembly protein TadB  35.96 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  35.4 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  38.53 
 
 		 141 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>