21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0486 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0486  protein of unknown function DUF477  100 
 
 
691 aa  1287    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2467  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.67 
 
 
683 aa  301  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000265482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5245  protein of unknown function DUF477  36.28 
 
 
695 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31440  methanol dehydrogenase  39.01 
 
 
694 aa  273  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0348274  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2744  hypothetical protein  34.92 
 
 
681 aa  272  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402013  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14950  protein of unknown function (DUF477)  37.04 
 
 
710 aa  257  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0578757  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1453  protein of unknown function DUF477  41.05 
 
 
681 aa  251  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3816  hypothetical protein  38.38 
 
 
662 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510191  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12369  transmembrane protein  35.03 
 
 
660 aa  243  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0843  protein of unknown function DUF477  38.19 
 
 
699 aa  239  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2720  hypothetical protein  37.34 
 
 
661 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0661419  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07010  protein of unknown function (DUF477)  35.77 
 
 
716 aa  233  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3455  hypothetical protein  34.84 
 
 
663 aa  220  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448044  normal  0.304109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3507  hypothetical protein  35.11 
 
 
663 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3444  hypothetical protein  35.11 
 
 
671 aa  215  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4793  protein of unknown function DUF477  37.46 
 
 
691 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2933  hypothetical protein  34.88 
 
 
689 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1427  hypothetical protein  31.88 
 
 
472 aa  92  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2817  hypothetical protein  44.25 
 
 
203 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.518823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0723  hypothetical protein  32.92 
 
 
512 aa  82.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000029152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  29.77 
 
 
229 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>