16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3449 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1497    99.13 
 
 		 2038 bp  2635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1498  transposase mutator type  99.3 
 
 		 1143 bp  2202    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2258  transposase mutator type  100 
 
 		 1218 bp  2415    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3449    100 
 
 		 3599 bp  7134    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3450  transposase mutator type  100 
 
 		 1218 bp  2415    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3341    78.64 
 
 		 1208 bp  345  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  94.44 
 
 		 2766 bp  56  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  92.11 
 
 		 2601 bp  52  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3607  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  92.11 
 
 		 1863 bp  52  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3284  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  92.11 
 
 		 1938 bp  52  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411961 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1451  diguanylate cyclase  88 
 
 		 1890 bp  52  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0524713  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3569  sensory box protein  85.96 
 
 		 3216 bp  50.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1500  sensory box protein  100 
 
 		 2997 bp  50.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  91.89 
 
 		 2082 bp  50.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  90.24 
 
 		 3213 bp  50.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3627  signal transduction protein  96.55 
 
 		 2130 bp  50.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>