More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0014 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0014  (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.652545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  64.86 
 
 
151 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  64.24 
 
 
151 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.24 
 
 
151 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  64.24 
 
 
151 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.24 
 
 
151 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.58 
 
 
151 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.86 
 
 
151 aa  210  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.58 
 
 
151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.58 
 
 
151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  63.58 
 
 
151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.19 
 
 
151 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  63.51 
 
 
156 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  63.51 
 
 
156 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3252  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.59 
 
 
151 aa  208  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256088  normal  0.660124 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.19 
 
 
151 aa  207  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3840  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.14 
 
 
167 aa  206  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25850  Ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  63.09 
 
 
156 aa  204  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4170  ferredoxin  61.49 
 
 
170 aa  201  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373967  normal  0.177637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2620  (2Fe-2S)-binding  60.14 
 
 
153 aa  199  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.33 
 
 
151 aa  197  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26060  oxidoreductase iron sulphur binding subunit  60.14 
 
 
152 aa  197  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.555573  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.67 
 
 
154 aa  197  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1317  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.63 
 
 
153 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  64.63 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.63 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.21 
 
 
187 aa  195  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  63.76 
 
 
151 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.51 
 
 
157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.67 
 
 
152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6356  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.67 
 
 
152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  60.96 
 
 
153 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2198  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.96 
 
 
177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185555  hitchhiker  0.00320999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4483  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.73 
 
 
152 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.51 
 
 
163 aa  194  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6768  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60 
 
 
152 aa  193  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.723083  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  63.95 
 
 
153 aa  193  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.33 
 
 
153 aa  193  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5482  (2Fe-2S)-binding  60 
 
 
152 aa  193  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  61.38 
 
 
153 aa  193  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  60 
 
 
152 aa  192  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0626  aldehyde dehydrogenase subunit III  59.46 
 
 
152 aa  192  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  60 
 
 
151 aa  191  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4114  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.33 
 
 
152 aa  191  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2662  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  58 
 
 
152 aa  191  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626504  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1416  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.14 
 
 
154 aa  191  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.86 
 
 
158 aa  191  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.59 
 
 
153 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0594  (2Fe-2S)-binding  56.67 
 
 
152 aa  190  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98773  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.59 
 
 
153 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.59 
 
 
153 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0874  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.81 
 
 
151 aa  190  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0913  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.81 
 
 
151 aa  190  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  62.42 
 
 
154 aa  189  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0849  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.14 
 
 
151 aa  189  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369182  normal  0.586703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.49 
 
 
163 aa  189  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  58.28 
 
 
166 aa  187  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2280  (2Fe-2S)-binding protein  62.76 
 
 
154 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.938299  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.5 
 
 
159 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3728  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.43 
 
 
152 aa  186  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1750  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.16 
 
 
151 aa  186  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4805  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.43 
 
 
152 aa  186  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.875575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.71 
 
 
171 aa  185  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2461  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.33 
 
 
159 aa  185  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7215  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.9 
 
 
153 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.05 
 
 
155 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3950  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.06 
 
 
164 aa  184  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.0539481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.93 
 
 
161 aa  184  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.93 
 
 
161 aa  184  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_003296  RS05442  dehydrogenase, small chain oxidoreductase protein  56 
 
 
152 aa  183  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.094889  normal  0.0167614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1703  (2Fe-2S)-binding protein  57.43 
 
 
167 aa  183  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0018  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.38 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2601  (2Fe-2S)-binding  59.86 
 
 
154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.346256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  60.4 
 
 
156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.4 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.67 
 
 
188 aa  181  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2266  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.33 
 
 
168 aa  181  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0955728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1743  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  62.75 
 
 
154 aa  181  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  56.08 
 
 
155 aa  181  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0273  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.74 
 
 
157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.46 
 
 
162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0806  (2Fe-2S)-binding protein  56.76 
 
 
153 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0756376  normal  0.191785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6069  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.73 
 
 
159 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2320  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.33 
 
 
152 aa  180  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3229  (2Fe-2S)-binding  54.42 
 
 
154 aa  180  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3465  (2Fe-2S)-binding  58.5 
 
 
154 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3557  (2Fe-2S)-binding  54.73 
 
 
152 aa  179  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.608806 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3776  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.73 
 
 
152 aa  179  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3977  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.5 
 
 
153 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156195  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2917  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.9 
 
 
153 aa  178  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4819  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.43 
 
 
151 aa  178  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2575  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58 
 
 
151 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  57.05 
 
 
152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  59.86 
 
 
152 aa  177  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6320  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.56 
 
 
157 aa  177  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3758  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.48 
 
 
153 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  0.0134234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3438  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  54.36 
 
 
151 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  61.43 
 
 
153 aa  176  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4893  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.11 
 
 
148 aa  176  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2224  (2Fe-2S)-binding  56.76 
 
 
150 aa  176  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>