More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6768 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6768  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
152 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.723083  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5482  (2Fe-2S)-binding  100 
 
 
152 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246902  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6356  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  98.03 
 
 
152 aa  300  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4114  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  92.11 
 
 
152 aa  285  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4805  (2Fe-2S)-binding domain protein  76.97 
 
 
152 aa  253  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.875575 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3728  (2Fe-2S)-binding domain protein  76.97 
 
 
152 aa  253  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05442  dehydrogenase, small chain oxidoreductase protein  77.63 
 
 
152 aa  251  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.094889  normal  0.0167614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2662  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  71.05 
 
 
152 aa  228  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626504  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0594  (2Fe-2S)-binding  66.45 
 
 
152 aa  222  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98773  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  63.09 
 
 
153 aa  209  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3557  (2Fe-2S)-binding  65.79 
 
 
152 aa  207  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.608806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0626  aldehyde dehydrogenase subunit III  65.13 
 
 
152 aa  204  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4483  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.5 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2320  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.59 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  60.53 
 
 
152 aa  194  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3252  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.76 
 
 
151 aa  194  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256088  normal  0.660124 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.09 
 
 
151 aa  193  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.27 
 
 
151 aa  192  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  63.09 
 
 
151 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.24 
 
 
187 aa  192  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6320  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.51 
 
 
157 aa  191  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.64 
 
 
188 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26060  oxidoreductase iron sulphur binding subunit  59.87 
 
 
152 aa  191  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.555573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4819  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.53 
 
 
151 aa  189  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1746  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  60.4 
 
 
153 aa  188  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.446262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2575  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.87 
 
 
151 aa  188  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.07 
 
 
153 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.4 
 
 
153 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211012  normal  0.305671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.94 
 
 
155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.42 
 
 
151 aa  187  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.07 
 
 
151 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2250  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  60.4 
 
 
153 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0922  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  60.4 
 
 
153 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1007  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  60.4 
 
 
153 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408478  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.4 
 
 
151 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3977  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62 
 
 
153 aa  187  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156195  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4836  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.73 
 
 
153 aa  186  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3530  (2Fe-2S)-binding  59.73 
 
 
153 aa  186  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  60.4 
 
 
153 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3758  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.06 
 
 
153 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  0.0134234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0849  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.87 
 
 
151 aa  186  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369182  normal  0.586703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3840  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.24 
 
 
167 aa  185  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5448  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.06 
 
 
153 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0179621 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2198  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.62 
 
 
177 aa  184  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185555  hitchhiker  0.00320999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0014  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.57 
 
 
151 aa  184  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.652545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2917  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62 
 
 
153 aa  184  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0086  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  59.73 
 
 
153 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1154  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  59.73 
 
 
153 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1530  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  59.73 
 
 
153 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  58.94 
 
 
151 aa  184  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7215  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.07 
 
 
153 aa  183  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.73 
 
 
151 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2280  (2Fe-2S)-binding protein  60.81 
 
 
154 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.938299  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  59.73 
 
 
151 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.73 
 
 
151 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  58 
 
 
166 aa  183  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5621  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.05 
 
 
157 aa  183  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  53.64 
 
 
156 aa  183  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  58.62 
 
 
153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1750  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.87 
 
 
151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  53.64 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0913  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.55 
 
 
151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40180  putative oxidoreductase  58.39 
 
 
153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948778  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0874  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.55 
 
 
151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.73 
 
 
151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3950  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.46 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.0539481 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3229  (2Fe-2S)-binding  56.67 
 
 
154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  59.73 
 
 
151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.73 
 
 
151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.21 
 
 
155 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.73 
 
 
157 aa  181  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  59.21 
 
 
155 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.21 
 
 
155 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  56 
 
 
154 aa  180  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.59 
 
 
153 aa  180  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.48 
 
 
151 aa  180  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3465  (2Fe-2S)-binding  59.06 
 
 
154 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3147  hypothetical protein  59.6 
 
 
152 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  58.11 
 
 
152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3438  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  56.85 
 
 
151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  56.95 
 
 
152 aa  177  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  55.41 
 
 
156 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.18 
 
 
152 aa  177  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.73 
 
 
163 aa  177  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0806  (2Fe-2S)-binding protein  54.97 
 
 
153 aa  176  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0756376  normal  0.191785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4306  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.59 
 
 
157 aa  176  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1831  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.29 
 
 
155 aa  176  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.672438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.77 
 
 
171 aa  176  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  52.63 
 
 
168 aa  176  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3164  ferredoxin like protein  57.62 
 
 
152 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25850  Ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  54.97 
 
 
156 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589202  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3902  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.62 
 
 
152 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1414  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.46 
 
 
150 aa  175  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0660371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.54 
 
 
163 aa  174  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2620  (2Fe-2S)-binding  56.38 
 
 
153 aa  174  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0278  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  59.15 
 
 
181 aa  174  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0864  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.28 
 
 
152 aa  174  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.383234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2224  (2Fe-2S)-binding  56.76 
 
 
150 aa  174  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1416  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.46 
 
 
154 aa  174  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.41 
 
 
154 aa  174  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>