36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3524 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3524  anti-sigma factor  100 
 
 		 103 aa  213  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1108  anti-sigma factor  58.89 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400545  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1380  hypothetical protein  57.83 
 
 		 97 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1398  hypothetical protein  57.83 
 
 		 97 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0698025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1414  hypothetical protein  57.83 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4688  hypothetical protein  52.33 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317438  normal  0.0385147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1779  hypothetical protein  51.76 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6291  anti-sigma factor  54.65 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13248  anti-sigma factor  59.3 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.434882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1409  anti-sigma factor  49.4 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.575969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30740  anti-sigma factor, TIGR02949 family  49.33 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4189  anti-sigma factor  45.35 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3713  hypothetical protein  47.37 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4094  anti-sigma factor RshA  45.78 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91245  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3767  anti-sigma factor  40.79 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.544196  normal  0.304611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5188  anti-sigma factor  42.47 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167688  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0962  anti-sigma factor RshA  39.73 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189444  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  38.96 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  42.25 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1707  anti-sigma factor  36.96 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.106573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3700  anti-sigma factor  36.62 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  39.44 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  40.85 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  37.33 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7736  anti-sigma factor  34.72 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  34.67 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1917  anti-sigma factor  34.78 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2491  anti-sigma factor  32.89 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  37.68 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  34.52 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0600  hypothetical protein  34.72 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1809  anti-sigma factor  27.06 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.847079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09500  anti-sigma factor, TIGR02949 family  33.33 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.394687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0755  anti-sigma factor  31.94 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19440  anti-sigma factor, TIGR02949 family  38.81 
 
 		 113 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1213  Anti-sigma factor RshA  29.73 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>