20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3048 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  899    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12217  hypothetical protein  39.74 
 
 		 257 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.616096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1381  hypothetical protein  36.52 
 
 		 410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3297  hypothetical protein  38.1 
 
 		 276 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514363  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3286  hypothetical protein  38.53 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3348  hypothetical protein  38.53 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160787  normal  0.0858239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2960  hypothetical protein  36.74 
 
 		 283 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  30.08 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3551  hypothetical protein  36.32 
 
 		 275 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6077  hypothetical protein  27.52 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.596344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2693  hypothetical protein  34.69 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3123  hypothetical protein  30.94 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.27337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  25.15 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3244  hypothetical protein  42.37 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00420433  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 420 aa  50.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 		 412 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.84 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  26.01 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2858  hypothetical protein  30.69 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.505703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>