More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2625 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 268 aa  528  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  82.09 
 
 		 268 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  70.3 
 
 		 268 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  70.52 
 
 		 268 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  64.66 
 
 		 268 aa  360  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  64.18 
 
 		 271 aa  345  3e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  53.61 
 
 		 273 aa  274  9e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  44.53 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.42 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.7 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.04 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.92 
 
 		 270 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.16 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.54 
 
 		 270 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.78 
 
 		 270 aa  204  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  39.54 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.37 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.37 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.16 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.79 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.34 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  41.6 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.64 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.09 
 
 		 276 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.61 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  34.59 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.85 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  36.5 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.56 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.09 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.06 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.23 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  31.02 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  40 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  32.63 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  34.91 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  37.14 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  40 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  36.79 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  28.83 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  38.1 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  38.1 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  35.24 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  38.1 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  24.47 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  30.13 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  34.62 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  34.62 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  34.62 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  34.62 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  34.62 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  25.99 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  34.62 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  34.62 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  34.62 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  33.01 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  35.58 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  33.64 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  28.22 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  32.38 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  33.94 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  33.65 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.432338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  33.65 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06760  uridylate kinase  32.71 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000401703  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  33.65 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  33.65 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  32.04 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  33.65 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  33.65 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  32.08 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1531  uridylate kinase  37.14 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  32.04 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  33.02 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01375  uridylate kinase  32.04 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00470454  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  32.04 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  33.65 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  33.65 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  34.62 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002748  uridylate kinase  32.69 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000503391  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0529  uridylate kinase  31.07 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.578978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  34.29 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  33.94 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03235  uridylate kinase  32.38 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  27.05 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  33.65 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  31.73 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  33.98 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  36.54 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  33.33 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  33.33 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  31.43 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  34.95 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2176  uridylate kinase  33.02 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  30.1 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  31.43 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  31.43 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  31.43 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23590  uridylate kinase  32.71 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.192648 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  31.43 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  31.43 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>