23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2211 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2211  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000554921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2016  hypothetical protein  84.79 
 
 		 309 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000702566 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5390  hypothetical protein  45.36 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00108195  hitchhiker  0.00662206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2457  putative signal peptide protein  40.14 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4059  putative signal peptide protein  41.46 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5703  hypothetical protein  41.75 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6457  hypothetical protein  41.75 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.275244 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6952  hypothetical protein  40.7 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4449  signal peptide protein  39.06 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5864  hypothetical protein  37.34 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03196  signal peptide protein  39.39 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3990  hypothetical protein  40.44 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00349291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1992  putative signal peptide protein  39.72 
 
 		 311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6392  hypothetical protein  41.46 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7056  hypothetical protein  41.46 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1436  hypothetical protein  41.46 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428223  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4156  putative signal peptide protein  39.49 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4268  signal peptide protein  39.49 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1736  hypothetical protein  40.16 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.685716  normal  0.675321 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6267  putative signal peptide protein  38.1 
 
 		 323 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5971  putative signal peptide protein  38.52 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2227  putative signal peptide protein  37.26 
 
 		 331 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.094679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2282  hypothetical protein  35.87 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>