20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1773 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2474  PEP-CTERM system associated protein  90.65 
 
 		 417 aa  751    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1773  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  848    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2471  hypothetical protein  43.63 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2361  hypothetical protein  38.56 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1981  hypothetical protein  37.38 
 
 		 409 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2218  PEP-CTERM system associated protein  32.55 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0903748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0834  putative lipoprotein  27.74 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0685  PEP-CTERM system associated protein  27.65 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.697185 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3067  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 440 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00656744  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2027  hypothetical protein  27.67 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0145  hypothetical protein  30.65 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2400  hypothetical protein  27.91 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2526  hypothetical protein  30.41 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.215866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1519  hypothetical protein  27.04 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0398559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2389  hypothetical protein  25.29 
 
 		 472 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0661  hypothetical protein  22.86 
 
 		 518 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0515751  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0284  hypothetical protein  32.28 
 
 		 511 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1982  hypothetical protein  33.91 
 
 		 501 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2581  hypothetical protein  51.28 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3116  hypothetical protein  25.75 
 
 		 543 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>