19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3018 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3018  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  37.84 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  35.8 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  34.48 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3192  methyltransferase type 12  36 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  31.53 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3118  methyltransferase type 12  28.28 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0061861  hitchhiker  0.0013011 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1615  hypothetical protein  30.35 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0192  hypothetical protein  27.36 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 1509 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  38.6 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  27.97 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  38.18 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  27.73 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  28.32 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  26.97 
 
 		 216 aa  42  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  27.68 
 
 		 396 aa  42  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  27.27 
 
 		 353 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>