More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1370 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  100 
 
 
350 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  41.81 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  36.72 
 
 
340 aa  250  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  39.45 
 
 
337 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  38.99 
 
 
343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  30.11 
 
 
374 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  29.19 
 
 
376 aa  149  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  27.73 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  27.47 
 
 
370 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  28.92 
 
 
377 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  28.03 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  34.92 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  34.92 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  28.15 
 
 
376 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  26.81 
 
 
377 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  31.92 
 
 
332 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  27.35 
 
 
379 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  27.61 
 
 
379 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.03 
 
 
382 aa  122  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
400 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.53 
 
 
311 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  27.85 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  32.83 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  33.63 
 
 
311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  38.31 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.18 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  35.78 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.89 
 
 
311 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  25.28 
 
 
365 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0534  aldo/keto reductase  36.18 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  28.84 
 
 
410 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.18 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.18 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  28.07 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.18 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0272  aldo/keto reductase  24.51 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.18 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  25.97 
 
 
397 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  36.71 
 
 
338 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2293  aldo/keto reductase  32.35 
 
 
294 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.253278  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  26.4 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  27.47 
 
 
376 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  26.67 
 
 
396 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.18 
 
 
311 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  36.41 
 
 
338 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0309  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.9 
 
 
275 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.52 
 
 
311 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  27.16 
 
 
399 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  29.13 
 
 
413 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  34.19 
 
 
331 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  36 
 
 
327 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  33.05 
 
 
351 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  35.75 
 
 
338 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0104  aldo/keto reductase  33.66 
 
 
294 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0779  hypothetical protein  23.1 
 
 
368 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000590838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  27.08 
 
 
400 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1410  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
285 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  33.18 
 
 
345 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  27.1 
 
 
383 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  26.17 
 
 
381 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  26.89 
 
 
406 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1705  aldo/keto reductase  32.84 
 
 
285 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  32.41 
 
 
341 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  33.78 
 
 
326 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  26.11 
 
 
409 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  28.98 
 
 
326 aa  102  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4129  aldo/keto reductase  33.78 
 
 
326 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0121527  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  28.5 
 
 
400 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  34.91 
 
 
349 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  24.25 
 
 
371 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  33.04 
 
 
322 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  33.51 
 
 
294 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  33.49 
 
 
339 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  34.27 
 
 
369 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  33.49 
 
 
339 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0152  aldo/keto reductase  28.03 
 
 
315 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.145765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  33.49 
 
 
339 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1335  aldo/keto reductase  32.35 
 
 
294 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  32.03 
 
 
332 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  33.64 
 
 
296 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3842  aldo/keto reductase  34.22 
 
 
326 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4526  aldo/keto reductase  34.22 
 
 
326 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150764  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1210  aldo/keto reductase  28.12 
 
 
315 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  31.69 
 
 
343 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5778  aldo/keto reductase  33.78 
 
 
326 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1081  aldo/keto reductase  32.51 
 
 
286 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  34.53 
 
 
324 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3018  aldo/keto reductase  33.67 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  34.67 
 
 
325 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  33.89 
 
 
311 aa  99.4  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  26.12 
 
 
381 aa  99.4  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2019  aldo/keto reductase  26.52 
 
 
380 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  34.22 
 
 
349 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  36 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  31.15 
 
 
331 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  24.66 
 
 
374 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  26.37 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  33.19 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  31.38 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>