196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2120 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
228 aa  461  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  86.84 
 
 
226 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.17 
 
 
234 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.21 
 
 
242 aa  185  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.9 
 
 
270 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.1 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.54 
 
 
243 aa  122  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.27 
 
 
239 aa  121  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.55 
 
 
223 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  36.06 
 
 
243 aa  118  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  33.17 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.32 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.93 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.88 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2984  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.49 
 
 
282 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0867151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.47 
 
 
238 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 
233 aa  99  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.83 
 
 
257 aa  98.2  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  34.02 
 
 
269 aa  98.2  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.38 
 
 
268 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.14 
 
 
236 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.01 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.4 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.4 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.27 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.97 
 
 
241 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3304  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.5 
 
 
290 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.359953  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.06 
 
 
242 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2927  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
328 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1455  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1427  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.15 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2905  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.45 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1400  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.57 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.04 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1025  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.74 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.03 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1312  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.74 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3182  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.74 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3055  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.74 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2291  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.74 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.49 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1421  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.2 
 
 
328 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2003  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.74 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.57 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.37 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.86 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  26.88 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1676  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  36.5 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.12 
 
 
249 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.9 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2296  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.39 
 
 
271 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3267  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.55 
 
 
266 aa  81.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  31.22 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.84 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.05 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  29.12 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.17 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.22 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.67 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.05 
 
 
249 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.42 
 
 
249 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.18 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.73 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.73 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.73 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  29.73 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.09 
 
 
269 aa  78.6  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.87 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.68 
 
 
266 aa  78.2  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.33 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.56 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.25 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.25 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.07 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  30.6 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3106  4-phosphopantetheinyl transferase  28.81 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.699639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.16 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.74 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.18 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.28 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.214486  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03246  HetI  34.73 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.32 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1604  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.95 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2625  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.69 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.52 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.16 
 
 
280 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.99 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1119  phosphopantetheinyl transferase-like protein  34.55 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3722  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.84 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  28.49 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2731  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.32 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  31.82 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  31.82 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2368  hypothetical protein  31.18 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2669  hypothetical protein  31.18 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>