42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5698 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 244 aa  457  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  60.32 
 
 		 265 aa  232  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  51.74 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3205  hypothetical protein  56.52 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0192  urease accessory protein UreF  43.89 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  45.18 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  43.36 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  43.1 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2754  hypothetical protein  45.06 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00731615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2831  urease accessory protein UreF  47.06 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2848  urease accessory protein UreF  46.61 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2804  urease accessory protein UreF  46.61 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0505  hypothetical protein  47.6 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3081  urease accessory protein UreF  44.69 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0273  Urease accessory protein UreF-like protein  34.51 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3505  Urease accessory protein UreF  36.61 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  47.01 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  26.47 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3408  putative urease accessory protein  32.91 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  31.9 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  24.07 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  42.86 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  25.75 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  25 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  29.31 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  20.59 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  28.87 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  31.33 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  23.25 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  29.18 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0696  Urease accessory protein UreF-like protein  35.46 
 
 		 302 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364387  unclonable  0.00000000313783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  26.8 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  26.97 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  27.9 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  30.4 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  24.56 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48625  predicted protein  28.79 
 
 		 666 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  31.56 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  31.36 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  30.29 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  29.39 
 
 		 230 aa  42  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  32.13 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>