18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4796 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4796  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05120  nuclease-like protein  42.38 
 
 		 1408 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.61882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4285  protein kinase  39.43 
 
 		 1427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0701  serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 		 1421 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1544  serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 		 1387 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2952  serine/threonine protein kinase  38.3 
 
 		 1406 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0113  protein kinase domain-containing protein  35.82 
 
 		 1400 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3204  protein kinase  32.28 
 
 		 1405 aa  148  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.375808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2466  hypothetical protein  30.91 
 
 		 656 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000584454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2640  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 		 657 aa  49.7  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0497  hypothetical protein  33.04 
 
 		 653 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1583  hypothetical protein  33.06 
 
 		 656 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00309667  normal  0.612487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3067  serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 		 656 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00164921  hitchhiker  0.00192059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  31.53 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2986  hypothetical protein  34.41 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.48 
 
 		 2051 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  32.1 
 
 		 573 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06347  protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14200)  27.69 
 
 		 674 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.479019  normal  0.0213442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>