More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2920 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  100 
 
 
291 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  50.89 
 
 
325 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  37.92 
 
 
310 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  37.62 
 
 
313 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  37.62 
 
 
313 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  37.62 
 
 
313 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  37.46 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  35.29 
 
 
316 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  26 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  31.02 
 
 
343 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  32.99 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  30.51 
 
 
322 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  34.26 
 
 
316 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  33.77 
 
 
316 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  36.79 
 
 
294 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  43.27 
 
 
293 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  32.94 
 
 
281 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  39.55 
 
 
257 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  38.1 
 
 
282 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  32.16 
 
 
288 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  32.97 
 
 
307 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  31.67 
 
 
330 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  39.79 
 
 
278 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  32.78 
 
 
313 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  32.46 
 
 
308 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  35.11 
 
 
287 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.69 
 
 
311 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  38.69 
 
 
307 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  42.6 
 
 
310 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  32.23 
 
 
309 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  35.25 
 
 
287 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
311 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  33.78 
 
 
305 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  31.51 
 
 
309 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  32.15 
 
 
319 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  40.94 
 
 
286 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  35.65 
 
 
298 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  33.79 
 
 
314 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  31.51 
 
 
309 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  33.56 
 
 
310 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  36.14 
 
 
327 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  37.04 
 
 
288 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.47 
 
 
306 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  33.62 
 
 
347 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.7 
 
 
287 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  31.19 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  33.67 
 
 
316 aa  99.4  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  36.94 
 
 
307 aa  99  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  29.13 
 
 
323 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  31.92 
 
 
313 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0241  luciferase family protein  35.71 
 
 
274 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  36.15 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  43.04 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  36.15 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  43.04 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  34.53 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  38.15 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  36.15 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  43.04 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  33.84 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  39.88 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  36.45 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  32.18 
 
 
484 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  36.31 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  35.78 
 
 
754 aa  96.3  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  37.57 
 
 
300 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  37.57 
 
 
300 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  27.78 
 
 
332 aa  95.9  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  33.91 
 
 
342 aa  95.9  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  31.62 
 
 
311 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  33.64 
 
 
290 aa  95.5  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  35.03 
 
 
758 aa  95.5  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  35.11 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  35.68 
 
 
299 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  29.39 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  30.95 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  36.11 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  36.32 
 
 
310 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.24 
 
 
328 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  29.66 
 
 
324 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  30.85 
 
 
309 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.76 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  36.18 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  27.33 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  36.59 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  33.73 
 
 
326 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  27.33 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  27.33 
 
 
338 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  31.98 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  33 
 
 
543 aa  92.8  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  31.85 
 
 
309 aa  92.4  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  30.62 
 
 
330 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  38.04 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  34.55 
 
 
339 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  34.04 
 
 
519 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  27.19 
 
 
321 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  31.87 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  35.47 
 
 
374 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  34.15 
 
 
306 aa  89.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>