24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2530 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2530  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  344  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4096  IS6 family transposase  81.69 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  69.15 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  68.09 
 
 		 213 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  65.26 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  77.78 
 
 		 262 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  77.78 
 
 		 212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  75 
 
 		 213 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  77.46 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  74.65 
 
 		 236 aa  110  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  65.48 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6782  hypothetical protein  70.59 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  58.75 
 
 		 237 aa  94.4  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  58.75 
 
 		 236 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  59.72 
 
 		 224 aa  89  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  61.11 
 
 		 237 aa  89  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1778  transposase  50 
 
 		 250 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.887632  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3163  putative transposase  70.83 
 
 		 96 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7111  putative transposase  62 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  58.14 
 
 		 211 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  33.77 
 
 		 218 aa  42  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  35.82 
 
 		 264 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  35.82 
 
 		 254 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  35.82 
 
 		 254 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>