More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1197 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1197  acetate kinase  100 
 
 
381 aa  743    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3545  acetate kinase  68.71 
 
 
433 aa  424  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0443913  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2195  acetate kinase  56.35 
 
 
358 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000385567  hitchhiker  0.000228017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1919  acetate kinase  56.32 
 
 
361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2971  acetate kinase  53.15 
 
 
361 aa  341  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3236  acetate kinase  52.04 
 
 
375 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0533415  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1272  acetate kinase  56.45 
 
 
362 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0858677  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  43.29 
 
 
404 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  42.74 
 
 
404 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  45.4 
 
 
405 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0522  acetate kinase  53.07 
 
 
344 aa  295  9e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.650195 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  38.38 
 
 
406 aa  291  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  40.55 
 
 
406 aa  290  4e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  36.5 
 
 
399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  34.84 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  37.59 
 
 
399 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  38.15 
 
 
403 aa  285  7e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  38.35 
 
 
403 aa  285  9e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  43.04 
 
 
380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  38.87 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2207  acetate kinase  42.13 
 
 
408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  36.46 
 
 
397 aa  281  1e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  44.59 
 
 
405 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  37.5 
 
 
401 aa  279  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  39.65 
 
 
401 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  40.05 
 
 
396 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  38.76 
 
 
397 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  37.4 
 
 
394 aa  277  3e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  37.98 
 
 
397 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  38.11 
 
 
397 aa  276  5e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  45.6 
 
 
378 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  36.27 
 
 
397 aa  276  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  37.25 
 
 
408 aa  275  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  37.69 
 
 
399 aa  275  8e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0354  acetate kinase  43.34 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  38.76 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  37.19 
 
 
404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  36.96 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  37.98 
 
 
397 aa  272  7e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  37.98 
 
 
397 aa  272  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  37.98 
 
 
397 aa  272  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  37.82 
 
 
395 aa  272  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  38.24 
 
 
397 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7535  acetate kinase  46.01 
 
 
381 aa  272  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315075  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  37.98 
 
 
397 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  37.98 
 
 
397 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  35.79 
 
 
394 aa  271  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  37.98 
 
 
397 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  41.82 
 
 
398 aa  270  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  38.24 
 
 
397 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  38.13 
 
 
397 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  37.98 
 
 
397 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  36.53 
 
 
417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  38.38 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  37.25 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  41.13 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  35.59 
 
 
398 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  37.79 
 
 
421 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4986  acetate kinase  46.54 
 
 
372 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  36.52 
 
 
398 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  43.04 
 
 
396 aa  265  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  35.5 
 
 
402 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  36.5 
 
 
421 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  38.89 
 
 
411 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  38.05 
 
 
421 aa  262  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  36.57 
 
 
397 aa  262  6.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  42.59 
 
 
394 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  41.29 
 
 
593 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  37.79 
 
 
421 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  36.75 
 
 
399 aa  260  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  42.17 
 
 
402 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  42.49 
 
 
422 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  36.69 
 
 
421 aa  258  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  37.63 
 
 
398 aa  258  9e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  37.53 
 
 
421 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4073  acetate kinase  47.7 
 
 
375 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  37.25 
 
 
401 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  42.06 
 
 
386 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  34.51 
 
 
394 aa  257  3e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  42.39 
 
 
405 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  37.82 
 
 
420 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  40.71 
 
 
589 aa  255  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  32.83 
 
 
397 aa  255  8e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3693  acetate kinase  47.01 
 
 
371 aa  255  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  37.73 
 
 
421 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  35.66 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  35.66 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  35.52 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  34.53 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  41.31 
 
 
397 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  34.53 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  33 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  36.1 
 
 
417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  35.19 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  33.25 
 
 
399 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  33.5 
 
 
398 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  35.48 
 
 
403 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3369  acetate kinase  43.78 
 
 
363 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.564026  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  34.68 
 
 
396 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  37.92 
 
 
406 aa  250  3e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>