28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0504 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0504  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1433  hypothetical protein  26.45 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0616369  normal  0.405263 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0139  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.75 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2432  zinc finger SWIM domain protein  34.76 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6254  zinc finger SWIM domain protein  33.13 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0052  zinc finger SWIM domain protein  27.5 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  25.73 
 
 		 1175 aa  54.7  0.0000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1868  zinc finger, SWIM-type  28.57 
 
 		 296 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2829  zinc finger SWIM domain protein  25.66 
 
 		 287 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  23.64 
 
 		 1152 aa  51.6  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3269  zinc finger SWIM domain protein  24.84 
 
 		 287 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.773769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1073  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.45 
 
 		 283 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1236  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.58 
 
 		 323 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.724844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0750  SWIM Zn-finger  25.66 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  24.05 
 
 		 1185 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0903  hypothetical protein  26.7 
 
 		 292 aa  49.3  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1197  zinc finger SWIM domain protein  26.14 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13835 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03220  SWIM zinc finger-containing protein  33.91 
 
 		 273 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.396624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4058  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.95 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.304195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28391  hypothetical protein  27.16 
 
 		 298 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  25.45 
 
 		 1194 aa  45.1  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12136  hypothetical protein  25.49 
 
 		 277 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.79135e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0457  zinc finger, SWIM-type  23.87 
 
 		 286 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.717379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1607  zinc finger SWIM domain protein  24.68 
 
 		 307 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1012  zinc finger SWIM domain protein  36.36 
 
 		 271 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00491  hypothetical protein  25.74 
 
 		 297 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0806  zinc finger SWIM domain-containing protein  25.81 
 
 		 366 aa  41.6  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2176  hypothetical protein  26.42 
 
 		 301 aa  41.2  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>