32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4510 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  503  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  73.81 
 
 		 263 aa  359  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  31.05 
 
 		 467 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  30.86 
 
 		 429 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  35.55 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  30.62 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  29.94 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  29.48 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  25.53 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  25.75 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  33.09 
 
 		 540 aa  52.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  33.59 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  29.07 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  30.17 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  39.29 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1095  NERD domain-containing protein  29.7 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00991797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  26.61 
 
 		 254 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  38.1 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  38.1 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  38.1 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  25.66 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  40 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  35.06 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  39.13 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  39.29 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  35.53 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  37.88 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  39.29 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4129  NERD domain protein  42.11 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2823  hypothetical protein  33.82 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00350669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  30.77 
 
 		 304 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2695  hypothetical protein  50 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.452372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>