49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4479 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  100 
 
 		 119 aa  235  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  76.71 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  44.59 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  45.45 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  43.42 
 
 		 321 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  43.75 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  42.86 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  41.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  44.16 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  42.86 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  39.24 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  47.83 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  39.08 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  47.83 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  45.71 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  35 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  38.64 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  46.77 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  46.77 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  38.89 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  35.9 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  35.9 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  41.43 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  37.5 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  40 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  40 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  41.43 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  40 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  38.89 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  44.78 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  32.97 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  36 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  36.36 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  38.67 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  34.38 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  37.5 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  37.5 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  44.44 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  37.5 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  40.85 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  39.44 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  32.88 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  35 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  35.37 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  35.62 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  38.03 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  36.49 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  36.49 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  37.66 
 
 		 81 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>