41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1409 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  100 
 
 		 111 aa  228  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  81.48 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  76.36 
 
 		 120 aa  177  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  63.81 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  62.86 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  66.28 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  58.06 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  62.79 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  58.24 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  58.14 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  52.69 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  54.65 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  55.91 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  55.68 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  52.22 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  54.55 
 
 		 99 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  53.93 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  53.93 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  52.27 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  52.27 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  53.01 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  56.41 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  56.25 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  56.25 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  56.63 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  55.7 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  54.43 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  47.67 
 
 		 95 aa  88.6  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  53.75 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  47.62 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  41.98 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  46.58 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  46.67 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  45.71 
 
 		 321 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  40 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  41.89 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  42.86 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  41.67 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  37.14 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  36.59 
 
 		 103 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  30.67 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>