50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0402 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  100 
 
 		 82 aa  166  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  68.92 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  66.23 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  66.22 
 
 		 77 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  64 
 
 		 79 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  66.22 
 
 		 82 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  62.16 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  62.5 
 
 		 76 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  60.81 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  56.76 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  56.76 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  52.7 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  56.34 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1410  NifZ protein, putative  54.17 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  37.5 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  37.33 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  37.5 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  36.49 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  34.67 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  36.62 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  33.33 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  32 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  32 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  34.21 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  39.44 
 
 		 321 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  35.21 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  30.99 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  37.14 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  33.78 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  32 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  33.78 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  34.67 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  32.88 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  35.14 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  31.17 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  36.62 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  29.33 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  34.72 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  33.33 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  33.33 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  31.43 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  39.44 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  39.44 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  28.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  33.8 
 
 		 146 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  28 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  29.87 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  26.76 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7746  hypothetical protein  47.62 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  30.67 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>