51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0964 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0964  NifZ  100 
 
 
99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  95.96 
 
 
99 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  84.54 
 
 
99 aa  173  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  77.78 
 
 
101 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  80.95 
 
 
101 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  67.86 
 
 
111 aa  124  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  67.82 
 
 
107 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  68.97 
 
 
108 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  60.82 
 
 
106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  62.65 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  62.65 
 
 
97 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  56.82 
 
 
126 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  55.68 
 
 
120 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  59.26 
 
 
97 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  64.1 
 
 
88 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  60 
 
 
104 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  60 
 
 
104 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  54.55 
 
 
111 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  63.29 
 
 
88 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  57.47 
 
 
107 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  53.41 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  55.06 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  53.09 
 
 
90 aa  97.4  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  51.09 
 
 
95 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  52.81 
 
 
94 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  52.81 
 
 
94 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  57.5 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  51.69 
 
 
94 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  52.69 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  48.24 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  48.24 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  50 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  48 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  45.68 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  48.1 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  44.3 
 
 
146 aa  70.1  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  47.14 
 
 
82 aa  67.8  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  44.16 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  39.02 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  42.11 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  38.36 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  40.24 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  38.36 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  37.5 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  36.71 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  36.71 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  35.62 
 
 
79 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  38.67 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  35.62 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  37.33 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  32 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>