42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4009 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  100 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  84.11 
 
 		 107 aa  176  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  67.86 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  51.02 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  51.02 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  54.35 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  60.24 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  60.24 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  55.06 
 
 		 99 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  56.96 
 
 		 97 aa  96.7  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  60 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  55.06 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  50.55 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  50.54 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  49 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  50.54 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  53.57 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  56.25 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  49.41 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  50.57 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  55.13 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  52.38 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  55.13 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  52.38 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  55 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  55.84 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  56.58 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  54.55 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  47.73 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  48.68 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  47.73 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  53.52 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  47.37 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  52.11 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  47.37 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  43.42 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  40 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  45.83 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  33.78 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  35.9 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  34.72 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  33.33 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>