40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1450 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  257  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  74.4 
 
 		 120 aa  189  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  81.48 
 
 		 111 aa  184  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  64.96 
 
 		 122 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  70.48 
 
 		 140 aa  153  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  60.22 
 
 		 106 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  67.44 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  62.79 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  58.14 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  60.47 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  55.81 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  51.61 
 
 		 100 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  57.95 
 
 		 99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  56.67 
 
 		 99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  56.82 
 
 		 99 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  51.11 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  54.65 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  54.65 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  62.86 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  55.13 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  51.16 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  55 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  55 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  49.48 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  50 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  50 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  49.4 
 
 		 94 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  51.28 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  51.25 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  47.67 
 
 		 92 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  43.21 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  48.65 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  45.95 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  48.57 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  42.86 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  44 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  41.43 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  40.28 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  37.14 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  29.87 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>