42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0401 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  100 
 
 		 111 aa  229  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  70 
 
 		 101 aa  141  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  61.11 
 
 		 108 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  60.78 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  62.22 
 
 		 101 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  61 
 
 		 99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  63.64 
 
 		 99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  58.42 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  66.67 
 
 		 99 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  53.85 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  53.19 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  53.33 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  46.6 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  47 
 
 		 97 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  57.14 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  46.07 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  52.94 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  50 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  48.15 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  48.15 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  43.48 
 
 		 95 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  47.5 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  44.71 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  44.71 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  46.43 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  46.99 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  46.99 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  45 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  47.5 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  46.34 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  43.82 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  48.65 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  47.3 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  44.29 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  44 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  44.29 
 
 		 321 aa  63.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  42.86 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  38.89 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  40 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  34.67 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  32.32 
 
 		 103 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  32.81 
 
 		 85 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>