42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0965 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0965  NifZ  100 
 
 
85 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  84.52 
 
 
85 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  80.52 
 
 
77 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  74.32 
 
 
76 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  69.44 
 
 
79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  66.23 
 
 
82 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  61.64 
 
 
81 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  63.01 
 
 
82 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  61.43 
 
 
89 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  56.16 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  56.16 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1410  NifZ protein, putative  56.34 
 
 
92 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  58.11 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  58.9 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  42.11 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  40.26 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  42.11 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  41.67 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  38.96 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  39.19 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  34.15 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  36.07 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  36.07 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  37.84 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  34.25 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  33.75 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  33.77 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  34.67 
 
 
321 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  35.14 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  33.33 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  35.71 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  35.62 
 
 
116 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  35.14 
 
 
94 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  35.14 
 
 
94 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  32.39 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  31.08 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  31.08 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  32.81 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  35.94 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  33.33 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  33.78 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  29.33 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>