37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3640 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  100 
 
 		 79 aa  164  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  78.57 
 
 		 76 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  68.42 
 
 		 77 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  69.44 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  65.28 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  62.5 
 
 		 81 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  62.5 
 
 		 82 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  64 
 
 		 82 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1410  NifZ protein, putative  61.43 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  56.94 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  56.94 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  55.88 
 
 		 89 aa  83.6  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  59.15 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  55.71 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  38.57 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  38.57 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  35.62 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  40 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  35.62 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  33.33 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  34.67 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  36.11 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  37.14 
 
 		 321 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  34.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  40.28 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  29.49 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  32.47 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  29.49 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  29.87 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7746  hypothetical protein  48.78 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  34.72 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  34.72 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  30.43 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  29.87 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  31.34 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  32.26 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  32.86 
 
 		 181 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>